Inexistência de mata cilçiar em mais de 90
o curso do rio ( 48 Km).
Erosão de solos explorados pela agropecuária intensiva em ampla faixa de suas margens.
Erosão (desbarrancamento) de suas margens causada pela força das águas, nas cheias.
Assoreamento progressivo em conseqüência dos fatores citados anteriormente.
Agricultura intensiva às margens do rio.
Queimadas da vegetação ciliar para a caça de roedores( preás).
Pesca predatória.
Lançamento de dejetos urbanos.
Acúmulo de lixo urbano nas margens e no leito
Poluição com resíduos industriais.
Retificação de trechos do rio, no passado.
Redução da cota do rio, por escassez de chuvas nas cabeceiras do Rio Imbé ( Serra do Mar) que dá origem a Lagoa de Cima ( nascente do Rio Ururaí)
Falta de corredores de vegetação para a fauna
Todos esses problemas causam a geração da pobreza.